MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus MSSA476 plasmid pSAS

Total Repeats: 237

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005951	CATA	2	8	659	666	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_005951	A	6	6	670	675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005951	T	6	6	709	714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_005951	T	6	6	741	746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005951	ATG	2	6	747	752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005951	A	6	6	755	760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005951	TAA	2	6	804	809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005951	TAT	2	6	872	877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_005951	ATT	2	6	888	893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005951	GTT	2	6	897	902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005951	TAAG	2	8	988	995	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005951	TAA	2	6	1040	1045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_005951	A	7	7	1044	1050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005951	TGA	2	6	1052	1057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005951	A	7	7	1066	1072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005951	ATTA	2	8	1124	1131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005951	T	6	6	1146	1151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005951	GAA	2	6	1164	1169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005951	T	6	6	1182	1187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_005951	GAA	3	9	1209	1217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005951	AAG	2	6	1324	1329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005951	TAA	2	6	1337	1342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005951	A	6	6	1341	1346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005951	AGAT	2	8	1364	1371	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005951	TAA	2	6	1385	1390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005951	A	6	6	1468	1473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005951	ATT	2	6	1519	1524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_005951	AGC	2	6	1712	1717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_005951	GAT	2	6	1721	1726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005951	GAT	2	6	1731	1736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005951	A	7	7	1766	1772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005951	GAA	2	6	1842	1847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005951	ATT	2	6	1873	1878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005951	TGT	2	6	1879	1884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005951	AAAG	2	8	1895	1902	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005951	TCAA	2	8	1933	1940	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_005951	ATG	2	6	1962	1967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_005951	AGA	2	6	1970	1975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005951	TAA	2	6	1990	1995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_005951	GATA	2	8	2045	2052	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_005951	ATG	2	6	2056	2061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_005951	AAG	2	6	2073	2078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_005951	AGA	2	6	2114	2119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_005951	AGA	2	6	2123	2128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_005951	TTTG	2	8	2164	2171	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005951	TAA	2	6	2508	2513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005951	ATT	2	6	3437	3442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005951	ATG	2	6	4100	4105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_005951	TCAT	2	8	4118	4125	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_005951	CCT	2	6	4134	4139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_005951	CT	3	6	4138	4143	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_005951	GA	3	6	4161	4166	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_005951	GAC	2	6	4169	4174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_005951	TC	3	6	4192	4197	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_005951	TAA	2	6	4221	4226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_005951	TGT	2	6	4228	4233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005951	TA	3	6	4234	4239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_005951	ATAA	2	8	4246	4253	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_005951	TTTG	2	8	4583	4590	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005951	GAT	2	6	4603	4608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_005951	A	6	6	4630	4635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_005951	TTAA	2	8	4668	4675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_005951	ATC	2	6	5422	5427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_005951	TAA	3	9	5484	5492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_005951	T	6	6	5593	5598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_005951	TAA	2	6	5618	5623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_005951	ACT	2	6	5646	5651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_005951	TAA	2	6	5671	5676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_005951	TTTA	2	8	5692	5699	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_005951	TA	3	6	5698	5703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_005951	TA	3	6	5721	5726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_005951	AAT	2	6	5730	5735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_005951	ATT	2	6	5756	5761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_005951	A	6	6	5772	5777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_005951	TTA	2	6	5788	5793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_005951	TAT	2	6	5828	5833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_005951	ACA	2	6	5848	5853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_005951	T	6	6	5898	5903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_005951	AT	3	6	5915	5920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_005951	ATG	2	6	5932	5937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_005951	GGTTG	2	10	5991	6000	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
82	NC_005951	ATTT	2	8	6018	6025	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_005951	TTA	2	6	6026	6031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_005951	AT	3	6	6052	6057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_005951	A	6	6	6066	6071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_005951	AAAG	2	8	6089	6096	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_005951	TAC	3	9	6116	6124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_005951	AAGA	2	8	6125	6132	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_005951	TAAA	2	8	6140	6147	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_005951	TTTA	2	8	6158	6165	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_005951	AGA	2	6	6183	6188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_005951	AGC	2	6	6229	6234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_005951	AAG	2	6	6265	6270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_005951	AAAT	2	8	6328	6335	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_005951	ATGA	2	8	6339	6346	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_005951	GAA	2	6	6434	6439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_005951	AATAT	2	10	6477	6486	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_005951	AATC	2	8	6491	6498	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_005951	ATC	2	6	6548	6553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_005951	A	6	6	6577	6582	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_005951	TGG	2	6	6640	6645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_005951	TAAA	2	8	6652	6659	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_005951	TAAT	2	8	6702	6709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_005951	TGA	2	6	6715	6720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_005951	GAA	3	9	6737	6745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_005951	ATT	3	9	6782	6790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_005951	T	7	7	6816	6822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_005951	T	6	6	6828	6833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_005951	A	7	7	6836	6842	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_005951	TGTA	2	8	6870	6877	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_005951	CA	3	6	6916	6921	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_005951	CATT	2	8	6967	6974	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_005951	TTAAA	2	10	7018	7027	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_005951	AGA	2	6	7067	7072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_005951	A	6	6	7136	7141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_005951	TTTTTG	2	12	7163	7174	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_005951	AT	3	6	7183	7188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_005951	TA	3	6	7220	7225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_005951	A	6	6	7298	7303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_005951	C	7	7	7310	7316	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
121	NC_005951	TTTC	2	8	7336	7343	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_005951	TCG	2	6	7353	7358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_005951	A	6	6	7368	7373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_005951	GTA	2	6	7411	7416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_005951	AATT	2	8	7432	7439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_005951	A	7	7	7487	7493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_005951	CGA	2	6	7495	7500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_005951	GAC	2	6	7575	7580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_005951	TTAT	2	8	7655	7662	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_005951	TAA	2	6	7692	7697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_005951	GAA	2	6	7818	7823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_005951	ATT	2	6	7953	7958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_005951	TCT	2	6	9011	9016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_005951	A	6	6	9031	9036	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_005951	TA	3	6	9043	9048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_005951	GAC	2	6	9055	9060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_005951	TATC	2	8	9072	9079	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_005951	GAT	2	6	9094	9099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_005951	ATA	2	6	9100	9105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_005951	TC	3	6	9119	9124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_005951	AG	3	6	9143	9148	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_005951	CAT	2	6	9182	9187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_005951	TCA	2	6	9196	9201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_005951	GCTGT	2	10	9205	9214	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
145	NC_005951	TAT	2	6	9219	9224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_005951	CAA	2	6	9245	9250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_005951	TAAT	2	8	9252	9259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_005951	A	6	6	9284	9289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_005951	AGT	2	6	9305	9310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_005951	TAG	2	6	9368	9373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_005951	ATA	2	6	9388	9393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_005951	AGT	2	6	9399	9404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_005951	AT	3	6	9426	9431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_005951	T	6	6	9445	9450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_005951	CATA	2	8	10458	10465	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
156	NC_005951	TA	3	6	10464	10469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_005951	TTG	2	6	10471	10476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
158	NC_005951	AT	3	6	10489	10494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_005951	TAA	2	6	10510	10515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_005951	T	6	6	11392	11397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_005951	T	7	7	11435	11441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_005951	TTAA	2	8	11447	11454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_005951	TCT	2	6	11497	11502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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165	NC_005951	AATG	2	8	11694	11701	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_005951	GTT	2	6	11754	11759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
170	NC_005951	TTC	2	6	11878	11883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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173	NC_005951	TA	3	6	11929	11934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_005951	GTT	2	6	11943	11948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
175	NC_005951	CCACGA	2	12	11993	12004	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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179	NC_005951	ATA	3	9	12243	12251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_005951	GA	3	6	12400	12405	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
182	NC_005951	TAA	2	6	12433	12438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_005951	ATT	2	6	12473	12478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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187	NC_005951	T	6	6	13445	13450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_005951	CTTA	2	8	13484	13491	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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191	NC_005951	TAA	2	6	13586	13591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_005951	TAT	2	6	13615	13620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_005951	CTT	2	6	15776	15781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
194	NC_005951	TAA	2	6	15793	15798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_005951	ATT	2	6	15828	15833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_005951	ATA	2	6	16732	16737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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199	NC_005951	TAT	2	6	16824	16829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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203	NC_005951	ATAA	2	8	16892	16899	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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237	NC_005951	AT	3	6	18333	18338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.